Organizimi dhe organet drejtuese të Qendrës A.L.T.R.I janë:
- a) Bordi Drejtues;
- b) Drejtori Ekzekutiv.
Organi më i lartë ekzekutiv i Qendrës është Bordi Drejtues i cili zgjedh Drejtorin Ekzekutiv për një mandat 4 (katër) vjeçar me të drejtë rimandatimi.
Qendra A.L.T.R.I drejtohet nga Znj. Eda Nocka, Drejtore Ekzekutive e Qendrës, e cila ka një eksperiencë të gjatë e të pasur në sektorin publik edhe atë privat. Që prej vitit 2009 ajo është angazhuar dhe është pjesë aktive e shoqërisë civile nëpërmjet zbatimit të një sërë iniciativash.
Me qëllim organizimin sa me efikas të punës në ndarjen dhe trajtimin e çështjeve të ndryshme, Qendra A.L.T.R.I, duke u nisur edhe nga eksperienca dhe specializimi juristëve dhe ekspertëve të saj, është organizuar në tre Njësi.